Для реставрационных работ в куполе Богоявленского собора монастыря «Нило — Столобенская пустынь» были приглашены ведущие реставраторы из Москвы. Реставрационные работы начались с историко — архивных изысканий и фотофиксации росписей до реставрации. Художники-реставраторы приступили к удалению слоя загрязнений и чёрной копоти, практически полностью закрывающей авторский красочный слой. Параллельно с этим ведется работа по удалению нахлёстов реставрационных вставок, заходящих на авторский красочный слой. Были освобождены от штукатурных наслоений границы авторского красочного слоя по всему периметру барабана. Реставрационные вставки, заходящие на авторский штукатурный слой, удалялись при помощи скальпеля с особой осторожностью. В результате удалось раскрыть значительные части росписи от штукатурных наслоений. Далее следуют работы по укреплению штукатурного и красочного слоев росписи, восполнение утрат штукатурного слоя и выполнение реконструкции утраченных частей росписи купола.